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<x-tab>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;</x-tab>Vitek or
API should have <i>Vibrio</i> and a variety of spirilla in their
databases.&nbsp; I am less sure of <i>Oceanospirillum</i>, but the bug
seems to be fairly easy to ID using microscope, a couple of biochem tests
and Bergey's (I've never done it myself though).&nbsp; Cyanobacteria
present a REAL problem.&nbsp; Over the past 30-40 years, no consensus has
been reached on the identification of cyanobacteria.&nbsp; Taxonomists of
the Botanical School of Thought have been replaced by microbiologists,
who re-classified blue-green algae as cyanobacteria and keep reassigning
genera almost daily.&nbsp; As it stands now, cyanobacteriologists do not
classify down to species -- genus and strain are deemed to be
sufficient.&nbsp; With the last representatives of the Botanical School
coming off the science scene, we will lose our ability to identify this
group of microorganisms down to species.&nbsp; This may answer one part
of your question.<br>
to genus, of cyano<b>bacteria</b> is done by microscopy alone.&nbsp; This
is probably due to the fact that all cyanobacteria are phototrophic, with
many of them being photoautotrophic.&nbsp; Therefore, sugar fermentation
is not a good diagnostic feature.&nbsp; The trick is that depending on
the growth conditions cyanobacteria may change morphology.&nbsp; So,
microscopy alone can also lead to mis-ID'ing.&nbsp; The 16S is of a
little help, since narrow-filaments cluster with unicells, some
halophilic unicells cluster together, apart from freshwater unicells,
etc.&nbsp; In addition, making axenic cultures is more than a pain --
sometimes cyanos refuse to live without symbionts.&nbsp; If I ever wanted
to make someone desperate, miserable and lose self-esteem, I would have
offered cleaning environmental cultures of cyanobacteria to
axenity.&nbsp; (Dutch -- if you are still following -- do not try to do
this at school!)<br>
<x-tab>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;</x-tab>On a
personal note, Yersinia, I wonder what you are doing now and how soon you
plan to graduate.&nbsp; Please drop me a note -- we may have an interest
in getting an intern (does not require a degree) sometime in the
future.&nbsp; <br>
<blockquote type=cite cite>I'm positive that no high school science lab
would have a Vitek or API <br>
strips on hand, and I doubt either of those systems would be of much use
in ID'ing many of the bugs found in the fishtanks, BUT....they do have
the chemical reaction wells, so do you think it would be possible to just
run the &quot;weird&quot; bugs through and use a combination of cell
morphology as <br>
seen through the microscope with the lists of reactions in Bergey's to
make the ID at least to genus level? For instance, a bug that ferments
glucose will still ferment the glucose in an API strip, even if the rest
of the reactions on the strip produce an ID not found in their database
(but might be used with that Bergey's to make, or disprove an ID)? Just
my own curiosity on this one, mind you - I doubt this will help Dutch,
and even my COLLEGE micro lab didn't have a Vitek or API strips, and we
never came close to doing anything like this in the course.<br>


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