IUBio GIL .. BIOSCI/Bionet News .. Biosequences .. Software .. FTP

<!doctype html public "-//W3C//DTD W3 HTML//EN">
<html><head><style type="text/css"><!--
blockquote, dl, ul, ol, li { padding-top: 0 ; padding-bottom: 0 }
 --></style><title>postdoctoral position</title></head><body>
<div align="center"><font size="+2"><b>Postdoctoral
position</b></font></div>
<div align="center"><font size="+2"><b><br></b></font></div>
<div align="center"><font size="+2"><b>Intraspecific variation in
developmental pathways.</b></font></div>
<div><br></div>
<div><font color="#000000">Dear colleagues,</font></div>
<div><font color="#000000"><br></font></div>
<div><font color="#000000">We are looking for an exceptionally capable
and motivated postdoctoral fellow prepared to take the leading role in
a study aimed at connecting variation in DNA sequences, developmental
pathways, and adult phenotypes.&nbsp; The three-year, NSF-funded
position can start as early as March 1, 2006.&nbsp; Experience in
population genetics, bioinformatics, and analysis and management of
large sequence data sets is a big plus.</font></div>
<div><font color="#000000"><br></font></div>
<div><font color="#000000">The goal of this project is to understand
how DNA sequence variation affects gene expression, and how
differences in gene expression translate into phenotypic variation,
using the<i> Drosophila bric a brac</i> (<i>bab</i>) locus as a
model.&nbsp; The<i> bab</i> locus, which consists of two closely
related transcription factors, is responsible for ~60% of genetic
variation in female cuticular pigmentation in a natural population
of<i> D. melanogaster</i>.&nbsp;<i> bab</i> also affects the
development of other sexually dimorphic traits, including the sex
comb, abdominal sternite bristles, and terminal filaments in the
ovary.&nbsp; We will sequence the entire 200-kb<i> bab</i> genomic
region from 100 isogenic lines and identify the SNPs and other
molecular polymorphisms associated with phenotypic differences among
lines.&nbsp; Simultaneously, population-genetic approaches will be
used to understand the evolutionary forces that control the
distribution of these polymorphisms in nature.&nbsp; We will then
quantify the levels of<i> bab</i> transcripts in phenotypically
divergent lines, and use this data to understand the impact of
molecular polymorphisms and their interactions on gene expression and
development. Finally, we will analyze DNA sequence and expression
variation in the upstream regulators and downstream targets of the Bab
transcription factors to understand how genetic variation is
transmitted through developmental pathways.&nbsp; The ultimate goal of
the project is to develop a predictive model that links molecular,
developmental, and phenotypic variation in natural
population.</font></div>
<div><font color="#000000"><br>
The project involves a close collaboration between two labs:&nbsp;
Artyom Kopp's (developmental genetics/ genomics/ evolution of
development) and Sergey Nuzhdin's (quantitative molecular genetics
and genomics).&nbsp; The research environment at UC - Davis will
offer the postdoctoral fellow an excellent chance to interact and
collaborate with many other people working in the fields of
evolutionary genetics and genomics.&nbsp; Northern California, where
Davis is located, offers a variety of recreational opportunities as
well.&nbsp; More information about UC - Davis can be found in the
links below.</font></div>
<div><font color="#000000">Kopp
lab:<x-tab>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
</x-tab><x-tab>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
</x-tab><u>http://www2.eve.ucdavis.edu/kopplab/</u></font></div>
<div><font color="#000000">Nuzhdin lab:<x-tab>&nbsp;&nbsp;&nbsp;
</x-tab><u>http://nlab.ucdavis.edu/node/view/177<br>
</u>Evolution and Ecology:<x-tab>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
</x-tab><u>http://www-eve.ucdavis.edu/<br>
</u>UCD Genome Center:<x-tab>&nbsp;&nbsp;
</x-tab><x-tab>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
</x-tab><u>http://www.genomecenter.ucdavis.edu/index_html.html<br>
</u>College of Biological Sciences:<x-tab>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
</x-tab><u>http://www.dbs.ucdavis.edu/<br>
</u>City of Davis:<x-tab>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
</x-tab><x-tab>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
</x-tab><u>http://www.ci.davis.ca.us/visitors.cfm</u></font><br>
</div>
<div>If interested, please contact Artyom Kopp at
akopp@ucdavis.edu</div>
<x-sigsep><pre>-- 
</pre></x-sigsep>
<div>Artyom Kopp<br>
Section of Evolution and Ecology&nbsp;&nbsp; and<br>
Center for Genetics and Development<br>
University of California - Davis<br>
Davis, CA 95616 USA<br>
lab (530) 752-8328<br>
office (530) 752-8657<br>
fax (530) 752-9014<br>
http://www2.eve.ucdavis.edu/kopplab/</div>
</body>
</html>

Send comments to us at archive@iubio.bio.indiana.edu