codon usage

Frank Fuerst ffrank at rz.uni-potsdam.de
Tue Dec 21 05:27:19 EST 1999


PN wrote:

> Is there any programs in the Web that could be used in analysis how
> optimal is the codon usage in my cDNA to be expressed in a certain
> species.

Not exactly what you want, but the codon usage of many organisms can
be found at
http://www.kazusa.or.jp/codon/

Analysing your cDNA for its codon usage should not be too hard using
standard unix tools.

Frank
-- 
Flhacs wird im Usenet grundsätzlich alsfhc geschrieben. Schreibt man
lafhsc nicht slfach, so ist das schlichtweg hclafs. Hingegen darf man
rihctig ruhig rhitcgi schreiben, weil eine shcalfe Schreibweise bei
irhictg nicht als shflac angesehen wird. [Hajo Pflüger in dnq]




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