IUBio GIL .. BIOSCI/Bionet News .. Biosequences .. Software .. FTP

Hello,<br><br>I am doing yeast (<i>S. cerevisiae</i>) transformation for the first time. <br><br>My current work flow is:<br><br><div style="margin-left: 40px;">ligation of yeast plasmid (pYC2/NT A) and gene of interest --&gt; &quot;1st&quot; 
<i>E. coli </i>transformation --&gt; plasmid extraction (check with enzyme digestion) --&gt; yeast (INV<i>Sc</i>1) transformation --&gt; plasmid extraction --&gt; &quot;2nd&quot; <i>E. coli </i>transformation --&gt; plasmid extraction (check with enzyme digestion) --&gt; yeast (INV
<i>Sc</i>1) transformation --&gt; over-expression of the protein<br></div><br>I have tried few method including Gietz, R.D. &amp; Schiestl, R.H. <u>Quick and Easy Yeast Transformation Using the LiAc/SS Carrier DNA/PEG Method
</u>. <i>Natural Protocols</i> (2007), and find the transformation yields are very satisfying.<br><br>But I am facing problem in plasmid extraction from yeast where I am getting low <i>E. coli </i>transformants. The yields are low in term of lower in number of colonies and smaller colonies, compare to 1st 
<i>E. coli </i>transformation. <br><br>For rapid isolation of plasmid from yeast, I am currently using both&nbsp; original and lab protocol which modified from Ausubel F.M., Brent, R., Kingston, R. E., Moore, D. D., Seidman, J. G., Smith, J. A., &amp; Struhl, K. 
<u>Short protocols in molecular biology: a compendium of methods from current protocols in molecular biology (5th ed)</u>, <i>New York: John Wiley &amp; Sons, Inc</i>. (2002), and Robzyk, K., and Kassir, Yona., <u>A simple and highly efficient procedure for rescuing autonomous plasmids from yeast
</u>, <i>Nucleic Acids Research</i> (1992).<br><br>I would like to ask:<br><ol><li>is it normal for the &quot;2nd&quot; transformation having lower yield compare to the &quot;1st&quot;?</li><li>if not, any other suggestion of plasmid extraction? i am using beads in the extraction.
</li><li>is the &quot;2nd&quot; <i>E. coli </i>transformation necessary? this step was include because most of the protocol i read do so, but i do not understand why. Can somebody brief explain? or suggest a reading material? 
<br></li></ol>Thank you very much.<br><br>Lau<br>

Send comments to us at archive@iubio.bio.indiana.edu