IUBio GIL .. BIOSCI/Bionet News .. Biosequences .. Software .. FTP

<HTML dir=ltr><HEAD><TITLE>[Zbrafish] storage of RNA samples for injection</TITLE>
<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=unicode">
<META content="MSHTML 6.00.6000.16674" name=GENERATOR></HEAD>
<BODY>
<DIV id=idOWAReplyText45948 dir=ltr>
<DIV dir=ltr><FONT face=Arial color=#000000 size=2>In general,</FONT></DIV>
<DIV dir=ltr><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV dir=ltr><FONT face=Arial size=2>We make small aliquots of RNA (5-10ul)&nbsp;diluted to the correct concentration in buffer/phenol red and store them at -80C.&nbsp; If we need to determine the correct concentration to inject, we store small aliquots of concentrated RNA at </FONT></DIV>
<DIV dir=ltr><FONT face=Arial size=2>-80C and dilute into buffer as needed.&nbsp; When we thaw an aliquot of RNA diluted in buffer to inject, we toss whatever we don't use.</FONT></DIV>
<DIV dir=ltr><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV dir=ltr><FONT face=Arial size=2>I would be surprised after going in and out of a tube of RNA and leaving it at 4degrees if there would be anything left the next day.&nbsp; Even if it didn't completely degrade, the concentration would be different for sure and may lead to variability in your experiments.</FONT></DIV>
<DIV dir=ltr><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV dir=ltr><FONT face=Arial size=2>Just my 2 cents worth,</FONT></DIV>
<DIV dir=ltr><FONT face=Arial size=2>Becky</FONT></DIV>
<DIV dir=ltr><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV dir=ltr><FONT face=Arial color=#000000 size=2></FONT>&nbsp;</DIV></DIV>
<DIV id=idSignature24657 dir=ltr><FONT face=Arial color=#000000>
<DIV class=MsoNormal><FONT face=Arial><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: Arial">
<DIV class=MsoNormal><FONT face=Arial size=1><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: Arial"><EM></EM></SPAN></FONT>&nbsp;</DIV></SPAN></FONT></DIV>
<DIV class=MsoNormal><FONT face=Arial><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: Arial">---------------------------------------------------</SPAN></FONT></DIV>
<DIV class=MsoNormal><FONT face=Arial><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: Arial">Rebecca D. Burdine, Ph.D.</SPAN></FONT></DIV>
<DIV class=MsoNormal><FONT face=Arial><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: Arial"></SPAN></FONT><FONT face=Arial><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: Arial">Assistant Professor</SPAN></FONT></DIV>
<DIV class=MsoNormal><FONT face=Arial><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: Arial">Dept. of Molecular Biology</SPAN></FONT></DIV>
<DIV class=MsoNormal><FONT face=Arial><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: Arial">Princeton</SPAN></FONT><FONT face=Arial><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: Arial"> University</SPAN></FONT></DIV>
<DIV class=MsoNormal><FONT face=Arial><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: Arial">Washington Road</SPAN></FONT><FONT face=Arial><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: Arial"> Mof 433</SPAN></FONT></DIV>
<DIV class=MsoNormal><FONT face=Arial><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: Arial">Princeton</SPAN></FONT><FONT face=Arial><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: Arial">, NJ 08544</SPAN></FONT><FONT face=Arial><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: Arial">&nbsp;</SPAN></FONT></DIV>
<DIV class=MsoNormal><FONT face="Times New Roman" size=2><SPAN style="FONT-SIZE: 12pt"></SPAN></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV class=MsoNormal><FONT face=Arial><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: Arial">Phone:&nbsp;(609) 258-7515</SPAN></FONT></DIV>
<DIV class=MsoNormal><FONT face=Arial><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: Arial">Fax: (609) 258-1343</SPAN></FONT></DIV>
<DIV class=MsoNormal><FONT face=Arial><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: Arial">Email: <A href="mailto:rburdine@princeton.edu" target=_blank>rburdine@princeton.edu</A></SPAN></FONT></DIV>
<DIV class=MsoNormal><FONT face=Arial><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: Arial">Admin Assistant: Cathy Falk (609) 258-1604</SPAN></FONT></DIV>
<DIV class=MsoNormal><FONT face=Arial><SPAN style="FONT-SIZE: 10pt; FONT-FAMILY: Arial"></SPAN></FONT>&nbsp;</DIV></FONT></DIV>
<DIV dir=ltr><BR>
<HR tabIndex=-1>
<FONT face=Tahoma size=2><B>From:</B> zbrafish-bounces@oat.bio.indiana.edu on behalf of yang.x@neu.edu<BR><B>Sent:</B> Tue 8/5/2008 5:11 PM<BR><B>To:</B> bionet-organisms-zebrafish@moderators.isc.org<BR><B>Subject:</B> [Zbrafish] storage of RNA samples for injection<BR></FONT><BR></DIV>
<DIV>
<P><FONT size=2>Just got another question. If I am injecting mRNA to embryos, shall I<BR>leave the left diluted mRNA at 4 degree for the next day? How long<BR>would it be good? Thanks a lot!<BR><BR>_______________________________________________<BR>Zbrafish mailing list<BR>Zbrafish@net.bio.net<BR><A href="http://www.bio.net/biomail/listinfo/zbrafish">http://www.bio.net/biomail/listinfo/zbrafish</A><BR></FONT></P></DIV></BODY></HTML>

Send comments to us at archive@iubio.bio.indiana.edu