IUBio GIL .. BIOSCI/Bionet News .. Biosequences .. Software .. FTP

<html><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">
<div><br></div>I have seen incredibly bright results with tandem dimer-tomato, but have not made a germ-line animal yet. <div><br><div>Animals harboring apparently single tdT (+) neurons were easily detected even with a 2.5 objective. </div><div><br></div><div>We did not find the signal to be too interfering to visualization of neighboring cells when expressed in just a few cells, however, when it was expressed in skin we could not see through tdT very well when using the TR filter. </div><div><br></div><div>Best, </div><div>W. Todd Penberthy </div><div><br><div><div>On Oct 21, 2008, at 11:22 AM, Philippe Herbomel wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite">Dear All,<div><br></div><div>We are wondering about the best red fluorescent reporter to make transgenic zebrafish with.</div><div>If one does not want to target the protein to a particular compartment (membrane or nucleus), DsRed2, the most used presently,  is probably the best (very bright, with reasonable maturation time).</div><div>If otherwise, the most used presently is mCherry, which is quite (4-fold) less bright. </div><div>Now from the Tsien lab papers' data, td-Tomato appears both much (over 5-fold) brighter than mCherry, and still compatible with membrane or nuclear targeting; </div><div>and indeed at least two papers then provided evidence that td-tomato was not only far superior to mcherry but even to GFP (in terms of brightness) as a reporter in transgenic mice.</div><div>Now surprisingly, when a colleague of us injected either mcherry or tdtomato mRNA into 1-cell zebrafish embryos,</div><div>she found td-Tomato to be less bright than mcherry.</div><div>So my question is: has anyone found this too, and/or tried to make transgenic zebrafish with td-Tomato as reporter ? And what about its actual brightness (and decay upon illumination) in zebrafish embryos/larvae, as compared to the mcherry and dsred2 ?</div><div><br></div><div>Thanks in advance for your testimonies on this. </div><div>I will post a summary of your responses !</div><div><br></div><div>Philippe Herbomel  </div><div><div><br></div><div><br></div></div><div> <span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; -webkit-text-decorations-in-effect: none; text-indent: 0px; -webkit-text-size-adjust: auto; text-transform: none; orphans: 2; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; "><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; -webkit-border-horizontal-spacing: 0px; -webkit-border-vertical-spacing: 0px; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; -webkit-text-decorations-in-effect: none; text-indent: 0px; -webkit-text-size-adjust: auto; text-transform: none; orphans: 2; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; "><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><font face="Helvetica" size="3" style="font: normal normal normal 12px/normal Helvetica; ">–––––––––––––––––––––––––––––––––––––––––</font></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><font face="Helvetica" size="3" style="font: normal normal normal 12px/normal Helvetica; ">Philippe Herbomel</font></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><font face="Helvetica" size="3" style="font: normal normal normal 12px/normal Helvetica; ">Unite Macrophages et Developpement de l'Immunite</font></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><font face="Helvetica" size="3" style="font: normal normal normal 12px/normal Helvetica; ">Departement de Biologie du Developpement</font></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><font face="Helvetica" size="3" style="font: normal normal normal 12px/normal Helvetica; ">Institut Pasteur</font></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><font face="Helvetica" size="3" style="font: normal normal normal 12px/normal Helvetica; ">25 rue du Dr Roux, 75724 Paris cedex 15, France</font></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; font: normal normal normal 12px/normal Helvetica; min-height: 14px; "><br></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><font face="Helvetica" size="3" style="font: normal normal normal 12px/normal Helvetica; ">tel. : 33 1 44 38 95 29<span class="Apple-converted-space"> </span><span class="Apple-converted-space"> <span class="Apple-converted-space"> </span></span>mobile: 33 6 73 35 74 20</font></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><font face="Helvetica" size="3" style="font: normal normal normal 12px/normal Helvetica; ">fax : 33 1 45 68 89 21</font></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; font: normal normal normal 12px/normal Helvetica; min-height: 14px; "><a href="http://www.pasteur.fr/recherche/RAR/RAR2006/Mdi-en.html">http://www.pasteur.fr/recherche/RAR/RAR2006/Mdi-en.html</a></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><font face="Helvetica" size="3" style="font: normal normal normal 12px/normal Helvetica; ">––––––––––––––––––––––––––––––––––––––</font></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><font class="Apple-style-span" color="#0721FF"><span class="Apple-style-span" style="color: rgb(7, 33, 255); ">Change the world one loan at a time - visit Kiva.org to find out how</span></font></div><br class="Apple-interchange-newline"></span></span></span><br class="Apple-interchange-newline"></span> </div><br><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">_______________________________________________</div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; ">Zbrafish mailing list</div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><a href="mailto:Zbrafish@net.bio.net">Zbrafish@net.bio.net</a></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><a href="http://www.bio.net/biomail/listinfo/zbrafish">http://www.bio.net/biomail/listinfo/zbrafish</a></div> </blockquote></div><br></div></div></body></html>

Send comments to us at archive@iubio.bio.indiana.edu